Stosowanie żelu z EDTA nie zwalnia od płukania kanału roztworem EDTA po zakończeniu jego preparacji. Stosowany w trakcie opracowywania żel nie zapewnia bowiem w pełni skutecznego usunięcia warstwy mazistej. Nie oznacza to jednak, by nie stosować tego typu preparatów. Zapewniają one bowiem m.in. poślizg narzędziom, pozwalając na ich penetrację w obręb wąskich kanałów korzeniowych.